En el Perú, los diferentes cuerpos acuáticos (ríos y lagos) estan poblados por especies de peces e invertebrados acuáticos, estos últimos compuestos básicamente por insectos, artrópodos, moluscos y otros taxones menores, que en conjunto agregan casi la totalidad de la fauna acuática conocida, a excepción de otros vertebrados acuáticos como mamíferos, reptiles y anfibios.

Si bien una notable fracción de los peces y en menor grado invertebrados acuáticos han sido descritos a nivel taxonómico y biogeográfico, existe el interés del CORBIDI por mantener diversas colecciones de referencia que no solo sirvan como material de consulta, sino además para desarrollar otras investigaciones enfocadas a contribuir con el conocimiento de las funciones ecológicas que desempeñan las diferentes especies en los ecosistemas acuáticos del Perú.

Desde el 2008 el CORBIDI incluirá una División de Fauna Acuática, que estará integrada por muestras de peces e invertebrados acuáticos como otro segmento de las colecciones biológicas depositadas en esta institución, las cuales inicialmente estarán compuestas por las contribuciones de sus investigadores asociados en el inmediato plazo y a futuro por iniciativas en investigación que gestione en proyectos de investigación, todo a fin de posicionarse como fuente de difusión de la diversidad biológica contenida en los cuerpos acuáticos del Perú.

Las colecciones del CORBIDI estarán adecuadamente preservadas, además de ser sistematizadas en una base de datos digital, que además de servir como fuente de información, también actuara como plataforma de intercambio de información con otras instituciones o investigadores en estos temas. Las consultas de la información y material contenido en las colecciones, estará a disposición de los interesados, a través de una solicitud remitida a los responsables de las colecciones que figuran en la División de Fauna Acuática.